菏泽市立医院康复医学科始建于2003年，发展迅速，成为鲁西南地区较大的康复训练中心，承接全市“三瘫一截”肢体残疾人的康复训练、技术指导、人才培养、康复知识普及、康复研究和残疾预防等工作，是菏泽市技术领先、服务一流的偏瘫康复机构。
康复医学科设有功能齐全的物理治疗室、运动治疗室、作业治疗室、语言治疗室及吞咽功能治疗室；拥有国内先进的大型康复治疗设备，如上肢康复评定治疗仪、电动起立床、减轻步态跑步机、上下肢主被动功能训练仪等，并引起了脑功能障碍治疗仪、痉挛肌治疗仪、中频治疗仪、蜡疗机、空气压力波、生物反馈治疗仪等。
康复医学科拥有一批经验丰富，经过正规训练的康复医学专业优秀人才，现有康复专家6名，医学硕士4名，康复治疗师10名，均在北京301医院、中国康复研究中心以及济南省级康复中心进修学习。运用“1对1”的康复治疗模式，采用当今先进的康复治疗理念和治疗方法，为康复病人进行多方面的综合评价并制定个性化的康复治疗方案。该治疗室积极开展神经康复相关领域中的科学研究，共主持及参与完成省级课题2项，市级课题20余项，并获省市级科技进步奖。先后撰写并出版专著10部，在国家核心期刊发表论文100余篇。
康复医学科业务范围包括脑血管病、脑外伤、脊髓损伤、创伤等所致的偏瘫、截瘫、言语障碍、吞咽功能障碍的康复功能评估及康复治疗。
