菏泽市立医院小儿外科是集临床诊疗、科研、教学于一体独立的小儿外科专科。承担着菏泽地区小儿各种先天性畸形、感染、肿瘤、创伤等疾病的诊断治疗。菏泽市立医院小儿外科已成为菏泽市最大的小儿外科疾病治疗中心。

小儿外科开放床位36张。现有医护人员22人，医生8人（主任1人，副主任1人，主治医师4人，住院医师2人），青年医生已全部硕士化。护理14人，主管护师3人，护师7人，护士4人，护理人员已全部本科化；该科室现有设备：拥有小儿腹腔镜1台、小儿膀胱镜1台、心电监护仪6台；婴儿保温箱2台；黄疸患儿蓝光治疗箱2台；微量输液泵6台；红外线治疗仪1台；以氧为动力的雾化吸入器等多种先进仪器及设备等。

1.新生儿外科手术：先天性畸形：包括消化道重复畸形、肠闭锁和肠狭窄、环状胰腺、先天性肠旋转不良，先天性十二指肠梗阻、脐膨出与腹裂、先天性幽门肥厚性狭窄、胆道闭锁、胆总管囊肿、脐膨出、腹裂、卵黄管瘘、脐尿管瘘、新生儿坏死性小肠结肠炎、胎粪性腹膜炎。先天性肛门和直肠发育畸形：肛门闭锁、肛门狭窄、无肛会阴瘘、直肠前庭瘘、直肠尿道瘘等。

2.小儿普外科疾病：小儿疝气、鳃裂囊肿（瘘）、甲舌囊肿（瘘）、美克尔憩室、脐疝、肠梗阻、急性出血坏死性小肠结肠炎、环状胰腺、肠系膜及大网膜囊肿、腹壁巨大切口疝修补、胃十二直肠手术、胆道手术、先天性胆道闭锁、复杂肛门直肠畸形、先天性巨结肠、乙状结肠冗长症、十二指肠瘀滞症、漏斗胸手术、先天性颈内静脉扩张症、肛周静脉扩张症等疾病诊治方面成绩卓著。

3.小儿泌外疾病：排尿异常：尿频、尿急、尿痛、排尿困难、小便失禁。脐尿管发育异常、尿道下裂、尿道上裂、尿道狭窄、尿道瓣膜、尿道息肉、尿道憩室、尿道口囊肿、尿道粘膜脱垂、阴茎阴囊转位、包茎、阴茎扭转、阴蒂肥大、小阴唇粘连、蹼状阴茎、隐睾、精索静脉曲张、隐匿阴茎、肾重复畸形、肾积水、输尿管积水和囊肿、膀胱输尿管返流后尿道瓣膜、两性畸形、输尿管结石、膀胱结石等的治疗。

4.小儿肿瘤：特别是小儿体表肿瘤包括：血管瘤、淋巴管瘤、软组织肿瘤、甲状腺肿瘤、纤维瘤、脂肪瘤、钙化上皮瘤、皮脂腺囊肿、表皮囊肿。小儿实体肿瘤：神经母细胞瘤、肝肾母细胞瘤、腹腔畸胎瘤、膀胱肿瘤、胰腺肿瘤、脾脏肿瘤、横纹肌肉瘤、纤维肉瘤、睾丸肿瘤、骶尾部畸胎瘤、肠道肿瘤等。有较熟练的操作。

5.感染性疾病：甲沟炎、脓性指头炎、淋巴结及淋巴管炎、新生儿脐炎、新生儿乳腺炎、蜂窝组织炎、疖肿、坏死性筋膜炎、包皮炎、肛周脓肿、盆腔脓肿、肛裂、肛瘘、化脓性甲状腺炎、乳腺炎、膀胱炎、附睾、睾丸炎、肝脾脓肿等。

6.创伤性疾病：各种小儿外伤：皮肤软组织裂伤、肝脾外伤、胃肠破裂伤、肾、输尿管、膀胱、尿道破裂伤、会阴部裂伤等各种车祸伤等。

7.小儿急腹症：消化道异物、阑尾炎、阑尾周围脓肿、嵌顿疝、胃扭转、空腔脏器破裂修补、胎粪性腹膜炎、肠套叠、肠梗阻、憩室穿孔、坏死性小肠结肠炎、急性胰腺炎、胆囊炎、胆囊结石、胆道穿孔、睾丸扭转、睾丸附件扭转、直肠脱垂、包皮嵌顿等。

8.小儿矫形主要是为先天性肌性斜颈多指及并指的治疗。

9.专业的小儿推拿、按摩（先天性斜颈）、尤其在小儿遗尿症疗效显著。具有中医特色的手法治疗为小儿治疗的一大特色。