菏泽市立医院胸外科最早创建于1977年，经过40多年几代人的不断努力，已发展成为国内胸外科一支很重要的队伍，科室在肺癌、食管癌以手术为主的综合治疗、疑难纵隔疾病的诊断及外科治疗等领域在本地区一直保持质量和数量上的传统领先地位。目前科室开放床位46张，年门诊量6000余人次，年手术量1000台以上。现有专业医师14名，其中主任医师2名，副主任医师6名，主治医师4名，住院医师2名。

胸外科手术创伤及风险大，专业性强，通过不断努力创新，手术技术及围手术期处理的提高及改进，挽救及延长了患者的生命，提高了患者的生存质量。胸外科有着辉煌的历史，食管癌手术方法被录入《全国著名特色医疗介绍》一书（中国标准出版社，1996年出版），左前外侧开胸食管癌切除左颈部吻合术荣获1992年菏泽市科技进步一等奖，廓清术治疗急性脓胸获1996年菏泽市科技成果一等奖，自发性食管破裂的治疗方法于1994年北北京医药信息咨询中心收录于《中国疑难病慢性特效疗法信息库》中。积极探索与开拓，全身心的为患者健康服务，是科室不懈的追求。近年来胸腔镜微创手术迅速发展，现全胸腔镜下肺叶切除与全胸腔镜下食管癌切除、胃食管颈部吻合等微创手术新技术已临床成熟并已逐渐推广，走在了山东省的前列。

胸外科每年承担泰山医学院及菏泽医学高等专科学校的临床医学系、护理系本科班、护理专科班等课堂授课、临床见习及实习任务。科内重视科研工作，近年来科内主编及参编了包括人民卫生出版社、科学出版社、山东科技出版社等出版的著作12部，发表在省级以上刊物上论著30余篇，其中被SCI收录的有4篇。胸外科重视对外学术交流，每年约有20人参加国际、全国及省级学术会议及专题讨论会。