小儿外科是山东省妇幼保健院新成立的科室，与山东省立医院小儿外科一脉相承，旨在更好地保证该省广大妇女儿童健康、促进健康山东建设。科室主要致力于新生儿畸形疾病的早期干预、疑难复杂畸形疾病的诊治、儿童微创外科等领域的基础及临床工作。
科室拟开展的特色诊疗项目有：1、产前咨询，对于孕妇产前体检发现的胎儿畸形，提供精确的诊断与预后评估。针对出生后需要尽早手术处理的先天性畸形，提供详细的围产期一体化管理，能极大地提高治愈率。如：先天性膈疝、食管闭锁、肠闭锁、肾积水、脐膨出、腹裂、畸胎瘤等。
2、腹腔镜微创手术治疗小儿腹股沟斜疝、鞘膜积液、隐睾等常见病。手术时间短，住院时间短、疗效确切，切口美观，恢复快，减少患儿痛苦。
3、先天性肛门直肠畸形的个体化治疗，根据每个患儿的畸形情况，制定精确的个体化的手术方案，努力让每个患儿都能有良好的控便功能。
4、腹腔镜辅助微创手术治疗先天性巨结肠、肥厚性幽门狭窄、十二指肠梗阻、胆总管囊肿、可疑腹部畸形的探查（大量便血可疑美克尔憩室、反复肠套叠、消化道异物等）。新生儿黄疸退黄效果不理想，大便发白，考虑胆道闭锁，腹腔镜微创探查，明确诊断。
5、胸腔镜微创手术治疗纵膈肿瘤、膈膨升、食管狭窄、漏斗胸、肺囊性腺瘤样畸形、隔离肺等胸部畸形。
6、小儿肿瘤：硬化剂和手术结合治疗血管瘤、淋巴管瘤，手术结合化疗治疗肾母细胞瘤、肝母细胞瘤、神经母细胞瘤、骶尾部畸胎瘤、卵巢肿瘤、睾丸肿瘤等。
7、小儿泌尿外科：小儿包茎、尿道下裂、埋藏阴茎的个体化手术治疗。腹腔镜微创手术治疗先天性肾积水、输尿管末端狭窄、重复肾输尿管畸形、膀胱输尿管返流等常见病。
8、各种小儿急腹症的诊断及处理，小儿阑尾炎、肠套叠、肠梗阻、睾丸扭转、卵巢囊肿蒂扭转、消化道穿孔、肠梗阻等。
