肝胆外科是在山东省最早的专病、专人、专业细化分工的科室，科室技术力量雄厚，聚集了一批省内外著名的肝胆外科、肝移植外科专家如胡宗泽教授、李杰教授、滕木俭教授等。科室装备有价值数百万元、诊疗肝胆胰疾病先进的设备仪器，如：术中B超（2台），纳米冷循环射频肿瘤治疗系统，电子十二指肠镜、纤维胆道镜、电子腹腔镜、氩气刀、CUSA等，并附设有超声室和内镜诊疗室。肝胆胰外科在国内率先引进和使用术中B超，术中B超的临床应用已超过5000例，肝脏切除2000余例，肝脏移植一百多例，肿瘤微创射频消融500多例（肝脏胰腺），位于全国领先水平。

自2000年在全省率先开展肝脏移植以来，在省内首先开展的新手术方式和新技术有：（1）改良背驮式原位肝脏移植术。（2）减体积肝脏移植术。（3）经典原位非转流肝脏移植术。（4）二次肝移植术（5）无输血肝脏移植术。（6）活体肝脏移植术。至今（截止2009年6月底）已完成115例（包括亲体肝移植1例）。良性终末期肝病移植肝脏1年存活率90.7%，3年存活率80%，5年存活率70%，肝脏恶性肿瘤移植肝脏1年存活率89%，3年存活率70%。拥有技术精湛的专业肝移植医护队伍，手术例数、手术成功率稳居全省领先水平。肝移植患者涵盖了因乙肝、丙肝、酒精肝、肝豆状核变性、胆汁性肝硬化等各种原因导致的终末期肝硬化以及肝癌、肝癌术后复发等疾病，也有因终末期肝并导致的肝昏迷、肝肾综合征、消化道出血等危重患者。目前已有3名患者存活时间超过7年半。年龄最大的患者72岁，60岁以上的患者18例，并完成不输血肝移植8例，肝移植技术达到了国内先进水平。2007年成为卫生部第一批肝移植准入医院，2008完成首例成人间右半肝活体肝移植；2008年被山东省委组织部及省政府批准授予设立山东省器官移植泰山学者岗位（肝脏、肾脏、心脏），上海市第一人民医院的院长彭志海出任山东省器官移植泰山学者岗位特聘专家，成为山东省设立的七个医学相关泰山学者岗位之一，充分反映了社会各界对山东省千佛山医院器官移植工作的认可。

从1992年开展了腹腔镜手术以来，目前可完成腹腔镜胰十二指肠切除、腹腔镜脾切除、肝切除、胆总管切开取石、胆囊切除、疝修补。在省内保持领先地位。

医院是山东省最早开展胆道镜、十二指肠镜诊断、治疗的科室之一，能开展逆行胰胆管造影（ERCP）、十二指肠乳头切开（EST）取石、鼻胆管引流、胆管狭窄扩张、内支架植入、胰管取石、胰管狭窄支架植入和术中、术后胆道镜取石等手术，并开展了腹腔镜、胆道镜、十二指肠镜联合治疗胆管结石的手术。

2001年开展在超声引导下，术中或体外行射频消融治疗肝脏肿瘤、肝脏转移瘤、胰腺肿瘤，至2009年完成射频消融治疗500多例次，对小肝癌达到手术切除的效果，对晚期肝癌、胰腺癌延长了患者生存期，部分患者长期带瘤生存，使肝脏胰腺肿瘤微创治疗居全省领先地位。

术中超声的使用是肝胆外科的一个优势，提高了肝内外胆管结石的取净率，引导多发肝肿瘤手术切除，并可在术中判断肿瘤的进展和手术的可行性，并可在术中进行射频、无水酒精注射等治疗。