山东大学第二医院建院初期即设有中医科，本着集医疗、教学、科研全面发展的目标，努力组建中医科，逐步发展为有医师5人，其中主任医师1人，主治医师4人的专业科室。
中医科秉持中西医结合的思想，充分运用中医整体理论和辨证论治的原则，同时注意将中医与现代分子生物学、基因学等前沿科学和现代实验技术和方法相结合，使中医科在各项医疗业务中都取得了长足的进步和提高。主要针对内科各种常见疾病及妇科的功能性疾病熟练运用中医的传统理论进行诊断和辩证施治，尤其在对流行性感冒、慢性支气管炎、胃炎、肠炎、便秘、糖尿病、月经不调、痛经、原发性闭经、不孕、痤疮、脱发、更年期综合症等疾病进行中医中药的辨证治疗上都取得了满意的疗效。开展针灸推拿业务方面，主要针对各种原因导致的偏瘫、周围神经损伤、周围性面瘫、颈肩腰腿痛、手术后所致的胃肠胀气、尿潴留、打嗝等疾病。在2005年6月引入针灸减肥项目，并应患者的要求安排针灸时间，受到患者的好评。在多年的工作中不断引入针灸领域中的各种新手法，扩大了疾病的诊治范围并收到了良好的效果。
教学与科研方面，中医科主要承担山东大学医学院中医教学任务，现承担山东大学6年制和七年制临床专业中医学的教学任务。目前科室承担局级以上课题3项，核心期刊发表论文10余篇。
