山东大学第二医院药学部作为医院的药学技术部门，承担着医院药事管理、药品供应、药品调剂及药学教学、科研等工作，致力于为公众提供优质、高效方便、快捷的药学服务，不断满足日益增长的医疗卫生需求。

药学部目前设有门诊药房、草药房、病房药房、液体室、药库、临床药学室、中心摆药室、静脉用药调配中心等8个部门。药学部人才荟萃，整体实力雄厚，拥有各级药学人员100余人，2名博士、20余名硕士，正、副主任药师4名。

药学部目前主要负责全院的药品供应、药品调剂、临床药学、药物不良反应监测、药物咨询等相关药学技术工作。其中，药库承担着全院药品使用的保障供应工作，严格执行药品审批程序，认真执行国家物价相关规定，降低药品价格，保证药品质量，及时公示药品价格；门急诊药房24小时值班，服务于门诊病人。药品调剂实行“双人复核制”，保证调剂工作的质量；草药房严格按照煎药专业操作规程，为患者提供中草药代煎服务；临床药师们专职专科参与临床查房和病例讨论，积极参与患者的药物治疗方案，为医生和患者提供用药咨询服务。同时，担负着药品不良反应监测、抗菌药物临床应用监测、处方点评监测网、药学信息服务、药物咨询服务等工作。

药学部高度重视药学教学、科研工作。近年来已获得省部级课题及院内课题8项，获山东省教育厅科技成果奖三等奖2项。在国内外药学杂志发表论文近50余篇，其中SCI收录10余篇，主编、参编论著4部。此外，根据药学部现有条件，挖掘有临床应用基础的中药协定处方，进行药物新制剂、新剂型的开发研究工作。荣获“山东省青年文明号”单位，2013年中国药学会信息工作先进单位，济南市”文明诚信药房”荣誉称号。